Klášter založil v roce 1263 Přemysl Otakar II. jako protiváhu kláštera ve Vyšším Brodě.
Klášter je položen na ostrohu obtékaném ze tří stran řekou Vltavou. Vlastní klášter je samostatně ohrazený a k němu se po jihozápadní straně připojuje předklášteří, rovněž obehnané hradbou.
Architektonické těžiště kláštera tvoří konventní kostel (trojlodní bazilika s příčnou lodí) orientovaný téměř na sever, k němuž se po jižní straně připojuje konvent s křížovou chodbou. Severně od něj stojí kaple Andělů strážných, k níž přiléhá tzv. malý konvent. Dále k severu následuje soubor budov opatství s pivovarem. Do jeho zadního nádvoří se vstupovalo od východu i západu gotickými branami.

Na stavbě kostela se podílel Michal Parléř, bratr Petra Parléře (stavitele chrámu sv. Víta).
Za husitských válek byl klášter vypálen a opraven byl až v 17. století.
Roku 1785 byl klášter zrušen a přeměněn v továrnu. Teprve roku 1909 se opět začalo s obnovou kláštera, který dnes slouží jako expozice Státní vědecké knihovny.

Otevírací doba:

1.4. - 31.5. a 1.9. - 31.10.
Úterý - neděle 9.00 - 12.00, 13.00 - 16.00

1.6. - 31.8.
Úterý - neděle 8.00 - 12.00, 13.00 - 17.00

Poslední prohlídka začíná 60 minut před koncem otevírací doby.

Prohlídky jsou s průvodcem, probíhají v češtině a podle schopnosti průvodce i v hlavních světových jazycích. Cizincům je zapůjčován i průvodcovský text v němčině, angličtině, francouzštině a maďarštině.

V objektu je instalována stálá výstava "Písemnictví v jižních Čechách" (prohlídka bez průvodce).

Celoročně je v klášteře otevřena badatelna oddělení rukopisů a vzácných tisků (pondělí - pátek 9.00 - 15.00, tel. +420 380 743 132), návštěva je možná po ohlášení.